Это Доктор процесс в памяти, что ли, прибил? Тогда понятно. Письмо с гадом оставалось в памяти тоссера, и Доктор его нашёл. Но он не знал, что это всего лишь данные, и решил, что лучше перебдеть.

Доктор не знает, с чем имеет дело. Он полагает, что нашёл процесс вируса — вот и выбивает его, чтобы не мешал лечить.