Я у себя наблюдал. Правда, весьма специфически — при остановке Eserv. Дело в том, что у меня подписка на Dr.Web для Eserv/2 давно закончилась (она мне и не нужна, я на Eserv/3 живу), поэтому тестовый Eserv при любом почтовом телодвижении сразу же ставит антивирус в запрет. У вас подписка случайно не закончилась? Что показывает интерфейс в параметрах почтового сервера по части антивируса?
Вывод — подписка ещё работает, а при подстановке "нового" dll — engine не запускается, т.ч. на настройки в интерфейсе смотреть вроде бы не надо. Может "вебовцы" опять что-нибудь в API подправили?